MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020523	ATGC	2	8	1	8	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020523	GTG	2	6	13	18	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020523	CA	4	8	27	34	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020523	CCG	2	6	45	50	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020523	G	6	6	58	63	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020523	CCG	2	6	99	104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020523	CCA	3	9	116	124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020523	CCA	3	9	150	158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020523	CCG	2	6	272	277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_020523	C	6	6	335	340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_020523	G	6	6	366	371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020523	GCA	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157220
13	NC_020523	CAC	2	6	437	442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
14	NC_020523	ACC	2	6	447	452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
15	NC_020523	AAC	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157220
16	NC_020523	GCAC	2	8	579	586	25 %	0 %	25 %	50 %	470157220
17	NC_020523	GCTG	2	8	632	639	0 %	25 %	50 %	25 %	470157220
18	NC_020523	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470157220
19	NC_020523	CCG	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157220
20	NC_020523	CGT	2	6	777	782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157220
21	NC_020523	ACC	2	6	795	800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
22	NC_020523	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157220
23	NC_020523	GTG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157220
24	NC_020523	CCA	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
25	NC_020523	CGCTA	2	10	1107	1116	20 %	20 %	20 %	40 %	470157220
26	NC_020523	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157220
27	NC_020523	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157220
28	NC_020523	GCA	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157220
29	NC_020523	GC	3	6	1336	1341	0 %	0 %	50 %	50 %	470157220
30	NC_020523	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
31	NC_020523	AAAC	2	8	1410	1417	75 %	0 %	0 %	25 %	470157220
32	NC_020523	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	470157220
33	NC_020523	TG	3	6	1561	1566	0 %	50 %	50 %	0 %	470157220
34	NC_020523	CCGG	2	8	1705	1712	0 %	0 %	50 %	50 %	470157220
35	NC_020523	GTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020523	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020523	CCA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_020523	TAA	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020523	TG	4	8	2021	2028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020523	T	7	7	2034	2040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020523	AGCA	2	8	2128	2135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020523	CAAT	2	8	2224	2231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020523	TGCA	2	8	2242	2249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020523	TCAC	2	8	2306	2313	25 %	25 %	0 %	50 %	470157221
45	NC_020523	CAC	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157221
46	NC_020523	GCGG	2	8	2392	2399	0 %	0 %	75 %	25 %	470157221
47	NC_020523	CAT	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157221
48	NC_020523	CGAG	2	8	2463	2470	25 %	0 %	50 %	25 %	470157221
49	NC_020523	ACC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157221
50	NC_020523	CGA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157222
51	NC_020523	CAC	4	12	2629	2640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157222
52	NC_020523	AGCA	2	8	2658	2665	50 %	0 %	25 %	25 %	470157222
53	NC_020523	TGC	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157222
54	NC_020523	AGCG	2	8	2799	2806	25 %	0 %	50 %	25 %	470157222
55	NC_020523	AGG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157222
56	NC_020523	GCTACC	2	12	2879	2890	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470157222
57	NC_020523	AGC	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157222
58	NC_020523	TGGAC	2	10	2919	2928	20 %	20 %	40 %	20 %	470157222
59	NC_020523	TGC	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157222
60	NC_020523	TGAG	2	8	3130	3137	25 %	25 %	50 %	0 %	470157222
61	NC_020523	CCG	2	6	3163	3168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157223
62	NC_020523	CAC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157223
63	NC_020523	T	6	6	3351	3356	0 %	100 %	0 %	0 %	470157223
64	NC_020523	CTA	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157223
65	NC_020523	TAC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157223
66	NC_020523	A	6	6	3477	3482	100 %	0 %	0 %	0 %	470157223
67	NC_020523	ACCA	2	8	3485	3492	50 %	0 %	0 %	50 %	470157223
68	NC_020523	ACTC	2	8	3553	3560	25 %	25 %	0 %	50 %	470157223
69	NC_020523	CG	3	6	3574	3579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020523	CG	3	6	3589	3594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020523	CTGG	2	8	3640	3647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020523	TGG	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020523	G	7	7	3745	3751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020523	GTG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020523	CGT	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157224
76	NC_020523	TAC	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157224
77	NC_020523	TAGC	2	8	3949	3956	25 %	25 %	25 %	25 %	470157224
78	NC_020523	TGCA	2	8	4039	4046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020523	TGC	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020523	TAG	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020523	TGCA	2	8	4092	4099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020523	TGCA	2	8	4101	4108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.